Topic outline
Bioinformatika (MD1090U013 - 1 SKS)
Selamat datang di mata kuliah Bioinformatika
Di dalam video pembelajaran ini, akan disampaikan Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK), Sub CPMK, Topik Pembelajaran dan Penilaian
Silakan memberikan komentar atau pertanyaan mengenai proses pembelajaran Bioinformatika
Pengantar Bioinformatika 1
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
Buatlah tulisan 2 - 3 halaman mengenai peran Gene Bank dalam Bioinformatika.
Sertakan sitasi dalam tugas
Pengantar Bioinformatika 2
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
Buatlah 2 - 3 halaman ringkasan mengenai Genome Annotation dengan referensi utama dibawah ini:
Yandell, M., Ence, D. A beginner's guide to eukaryotic genome annotation. Nat Rev Genet 13, 329–342 (2012). https://doi.org/10.1038/nrg3174
JIka diperlukan boleh menggunakan referensi lain (sertakan sitasinya).
Analisis sekuens protein
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
Analisis protein 3 dimensi
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
- Pilihlah 1 protein
- Lakukan analisis 3 dimensi menggunakan software yang tersedia
- Berikan analisisnya
Desain Primer
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
Sequence Alignment
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
Buatlah analisis dari sekuens terlampir dan diskusikan
Phylogenetic Analysis
- Proses pembelajaran minggu ini akan dimulai dengan menonton video pembelajaran.
- Setelah menoton video pembelajaran, mahasiswa akan diminta untuk membuat ringkasan dari paper yang diberikan.
- Staf Pengajar akan memberikan umpan balik dari tugas yang diberikan pada akhir minggu
- Setelah mengerjakan tugas, forum diskusi mengenai topik pada minggu ini akan dibuka
Buatlah ringkasan dari paper terlampir
Evaluasi Akhir
- Pilihlah 1 protein
- Buatlah analisis fungsi, regulasi genetik yang terjadi
- Desainlah beberapa pasang primer
- Buatlah analisis protein 2D dan 3D
Waktu yang diberikan adalah 2 minggu.